Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ33

Ticrr, Treslin, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TicrrQ8BQ33 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TicrrQ8BQ33 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TicrrQ8BQ33 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TicrrQ8BQ33 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TicrrQ8BQ33 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TicrrQ8BQ33 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TicrrQ8BQ33 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TicrrQ8BQ33 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TicrrQ8BQ33 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TicrrQ8BQ33 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TicrrQ8BQ33 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TicrrQ8BQ33 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TicrrQ8BQ33 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TicrrQ8BQ33 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TicrrQ8BQ33 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TicrrQ8BQ33 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.83■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TicrrQ8BQ33 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TicrrQ8BQ33 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
TicrrQ8BQ33 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TicrrQ8BQ33 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TicrrQ8BQ33 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TicrrQ8BQ33 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TicrrQ8BQ33 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TicrrQ8BQ33 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
TicrrQ8BQ33 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TicrrQ8BQ33 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TicrrQ8BQ33 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TicrrQ8BQ33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TicrrQ8BQ33 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TicrrQ8BQ33 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TicrrQ8BQ33 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TicrrQ8BQ33 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
TicrrQ8BQ33 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TicrrQ8BQ33 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TicrrQ8BQ33 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TicrrQ8BQ33 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TicrrQ8BQ33 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TicrrQ8BQ33 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms