Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ08

5730596B20Rik, RIKEN cDNA 5730596B20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730596B20RikQ8BQ08 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
5730596B20RikQ8BQ08 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5730596B20RikQ8BQ08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
5730596B20RikQ8BQ08 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
5730596B20RikQ8BQ08 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
5730596B20RikQ8BQ08 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms