Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMG1

Atrip, ATR-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtripQ8BMG1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AtripQ8BMG1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AtripQ8BMG1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AtripQ8BMG1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AtripQ8BMG1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
AtripQ8BMG1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
AtripQ8BMG1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AtripQ8BMG1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
AtripQ8BMG1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
AtripQ8BMG1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
AtripQ8BMG1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
AtripQ8BMG1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
AtripQ8BMG1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
AtripQ8BMG1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
AtripQ8BMG1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
AtripQ8BMG1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
AtripQ8BMG1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
AtripQ8BMG1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AtripQ8BMG1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AtripQ8BMG1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AtripQ8BMG1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AtripQ8BMG1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AtripQ8BMG1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AtripQ8BMG1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AtripQ8BMG1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms