Protein–RNA interactions for Protein: Q8BLA8

Trpa1, Transient receptor potential cation channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpa1Q8BLA8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trpa1Q8BLA8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trpa1Q8BLA8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Trpa1Q8BLA8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trpa1Q8BLA8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trpa1Q8BLA8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trpa1Q8BLA8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trpa1Q8BLA8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms