Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJF9

Chmp2b, Charged multivesicular body protein 2b, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2bQ8BJF9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chmp2bQ8BJF9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Chmp2bQ8BJF9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Chmp2bQ8BJF9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Chmp2bQ8BJF9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Chmp2bQ8BJF9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Chmp2bQ8BJF9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Chmp2bQ8BJF9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Chmp2bQ8BJF9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Chmp2bQ8BJF9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms