Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
D130040H23RikQ8BII3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
D130040H23RikQ8BII3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
D130040H23RikQ8BII3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
D130040H23RikQ8BII3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
D130040H23RikQ8BII3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
D130040H23RikQ8BII3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
D130040H23RikQ8BII3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
D130040H23RikQ8BII3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
D130040H23RikQ8BII3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
D130040H23RikQ8BII3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
D130040H23RikQ8BII3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
D130040H23RikQ8BII3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
D130040H23RikQ8BII3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
D130040H23RikQ8BII3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms