Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH97

Rcn3, Reticulocalbin-3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn3Q8BH97 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rcn3Q8BH97 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rcn3Q8BH97 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rcn3Q8BH97 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rcn3Q8BH97 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rcn3Q8BH97 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rcn3Q8BH97 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rcn3Q8BH97 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rcn3Q8BH97 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rcn3Q8BH97 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rcn3Q8BH97 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rcn3Q8BH97 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rcn3Q8BH97 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcn3Q8BH97 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rcn3Q8BH97 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms