Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH48

Ubap1, Ubiquitin-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubap1Q8BH48 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubap1Q8BH48 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubap1Q8BH48 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ubap1Q8BH48 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubap1Q8BH48 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ubap1Q8BH48 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubap1Q8BH48 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubap1Q8BH48 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubap1Q8BH48 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms