Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGT7

Smndc1, Survival of motor neuron-related-splicing factor 30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smndc1Q8BGT7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Smndc1Q8BGT7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Smndc1Q8BGT7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smndc1Q8BGT7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Smndc1Q8BGT7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Smndc1Q8BGT7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Smndc1Q8BGT7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smndc1Q8BGT7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smndc1Q8BGT7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Smndc1Q8BGT7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smndc1Q8BGT7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smndc1Q8BGT7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.8 ms