Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim6Q8BGE7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Trim6Q8BGE7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim6Q8BGE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim6Q8BGE7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trim6Q8BGE7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim6Q8BGE7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim6Q8BGE7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim6Q8BGE7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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