Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Pknox2Q8BG99 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Pknox2Q8BG99 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Pknox2Q8BG99 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Pknox2Q8BG99 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Pknox2Q8BG99 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pknox2Q8BG99 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pknox2Q8BG99 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pknox2Q8BG99 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms