Protein–RNA interactions for Protein: Q810Y9

Pramel6, PRAMEl6, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel6Q810Y9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pramel6Q810Y9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pramel6Q810Y9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pramel6Q810Y9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Pramel6Q810Y9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pramel6Q810Y9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pramel6Q810Y9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pramel6Q810Y9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pramel6Q810Y9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pramel6Q810Y9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pramel6Q810Y9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Pramel6Q810Y9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Pramel6Q810Y9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Pramel6Q810Y9 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pramel6Q810Y9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pramel6Q810Y9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Pramel6Q810Y9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pramel6Q810Y9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pramel6Q810Y9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pramel6Q810Y9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pramel6Q810Y9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pramel6Q810Y9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Pramel6Q810Y9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pramel6Q810Y9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pramel6Q810Y9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pramel6Q810Y9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pramel6Q810Y9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pramel6Q810Y9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pramel6Q810Y9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pramel6Q810Y9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms