Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZJ6

Zer1, Protein zer-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zer1Q80ZJ6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Zer1Q80ZJ6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Zer1Q80ZJ6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Zer1Q80ZJ6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Zer1Q80ZJ6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Zer1Q80ZJ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zer1Q80ZJ6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zer1Q80ZJ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms