Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD8

Prap1, Proline-rich acidic protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prap1Q80XD8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prap1Q80XD8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prap1Q80XD8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prap1Q80XD8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prap1Q80XD8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Prap1Q80XD8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Prap1Q80XD8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prap1Q80XD8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Prap1Q80XD8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prap1Q80XD8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prap1Q80XD8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Prap1Q80XD8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Prap1Q80XD8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Prap1Q80XD8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Prap1Q80XD8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms