Protein–RNA interactions for Protein: Q80W93

Hydin, Hydrocephalus-inducing protein, mousemouse

Predictions only

Length 5,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HydinQ80W93 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,3■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15,3■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,3■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,29■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,28■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15,28■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,28■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,28■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,28■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,27■□□□□ 0,04
HydinQ80W93 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,26■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15,26■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15,25■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15,25■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15,24■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,24■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,23■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15,22■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,22■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,21■□□□□ 0,03
HydinQ80W93 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC15,2■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15,2■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15,2■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15,2■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,19■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15,16■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,16■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15,16■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15,15■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15,15■□□□□ 0,02
HydinQ80W93 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15,13■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15,13■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15,12■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,12■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15,12■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15,11■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15,11■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC15,1■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC15,1■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,1■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,09■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0,01
HydinQ80W93 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,08■□□□□ 0
HydinQ80W93 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15,08■□□□□ 0
HydinQ80W93 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
HydinQ80W93 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,07■□□□□ 0
HydinQ80W93 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15,07■□□□□ 0
HydinQ80W93 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15,07■□□□□ 0
HydinQ80W93 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15,07■□□□□ 0
HydinQ80W93 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15,07■□□□□ 0
HydinQ80W93 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15,07■□□□□ 0
HydinQ80W93 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15,07■□□□□ 0
HydinQ80W93 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15,05■□□□□ -0
HydinQ80W93 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15,04■□□□□ -0
HydinQ80W93 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15,04■□□□□ -0
HydinQ80W93 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,03■□□□□ -0
HydinQ80W93 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,02■□□□□ -0
HydinQ80W93 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15,02□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15,02□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15,01□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC14,99□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,99□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14,99□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14,99□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14,99□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC14,98□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,98□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC14,98□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC14,97□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14,97□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,96□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC14,96□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14,96□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14,96□□□□□ -0,01
HydinQ80W93 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14,95□□□□□ -0,02
HydinQ80W93 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14,95□□□□□ -0,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,1 ms