Protein–RNA interactions for Protein: Q80UJ1

Slc22a20, Solute carrier family 22 member 20, mousemouse

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a20Q80UJ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc22a20Q80UJ1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc22a20Q80UJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Slc22a20Q80UJ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc22a20Q80UJ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc22a20Q80UJ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc22a20Q80UJ1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms