Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rexo1Q7TT28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
Rexo1Q7TT28 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rexo1Q7TT28 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Rexo1Q7TT28 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Rexo1Q7TT28 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rexo1Q7TT28 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rexo1Q7TT28 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rexo1Q7TT28 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rexo1Q7TT28 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rexo1Q7TT28 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rexo1Q7TT28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rexo1Q7TT28 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Rexo1Q7TT28 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rexo1Q7TT28 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms