Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ckap2lQ7TS74 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ckap2lQ7TS74 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckap2lQ7TS74 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ckap2lQ7TS74 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ckap2lQ7TS74 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ckap2lQ7TS74 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ckap2lQ7TS74 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap2lQ7TS74 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ckap2lQ7TS74 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ckap2lQ7TS74 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ckap2lQ7TS74 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ckap2lQ7TS74 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ckap2lQ7TS74 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ckap2lQ7TS74 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ckap2lQ7TS74 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms