Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPW1

Nexn, Nexilin, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NexnQ7TPW1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NexnQ7TPW1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NexnQ7TPW1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NexnQ7TPW1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NexnQ7TPW1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NexnQ7TPW1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.08■■■□□ 2.57
NexnQ7TPW1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
NexnQ7TPW1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NexnQ7TPW1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
NexnQ7TPW1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
NexnQ7TPW1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
NexnQ7TPW1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
NexnQ7TPW1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
NexnQ7TPW1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NexnQ7TPW1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
NexnQ7TPW1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
NexnQ7TPW1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
NexnQ7TPW1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NexnQ7TPW1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
NexnQ7TPW1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NexnQ7TPW1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NexnQ7TPW1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NexnQ7TPW1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NexnQ7TPW1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NexnQ7TPW1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NexnQ7TPW1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NexnQ7TPW1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NexnQ7TPW1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NexnQ7TPW1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NexnQ7TPW1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
NexnQ7TPW1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms