Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNH6

Nphp3, Nephrocystin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp3Q7TNH6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Nphp3Q7TNH6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nphp3Q7TNH6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Nphp3Q7TNH6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nphp3Q7TNH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Nphp3Q7TNH6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Nphp3Q7TNH6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nphp3Q7TNH6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Nphp3Q7TNH6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Nphp3Q7TNH6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
Nphp3Q7TNH6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Nphp3Q7TNH6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Nphp3Q7TNH6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nphp3Q7TNH6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nphp3Q7TNH6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Nphp3Q7TNH6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nphp3Q7TNH6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Nphp3Q7TNH6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Nphp3Q7TNH6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Nphp3Q7TNH6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Nphp3Q7TNH6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp3Q7TNH6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp3Q7TNH6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Nphp3Q7TNH6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
Nphp3Q7TNH6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nphp3Q7TNH6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Nphp3Q7TNH6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Nphp3Q7TNH6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Nphp3Q7TNH6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nphp3Q7TNH6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Nphp3Q7TNH6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Nphp3Q7TNH6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nphp3Q7TNH6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Nphp3Q7TNH6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp3Q7TNH6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Nphp3Q7TNH6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp3Q7TNH6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Nphp3Q7TNH6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Nphp3Q7TNH6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Nphp3Q7TNH6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Nphp3Q7TNH6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Nphp3Q7TNH6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nphp3Q7TNH6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Nphp3Q7TNH6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Nphp3Q7TNH6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms