Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eci3Q78JN3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Eci3Q78JN3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Eci3Q78JN3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Eci3Q78JN3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Eci3Q78JN3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Eci3Q78JN3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eci3Q78JN3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eci3Q78JN3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eci3Q78JN3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eci3Q78JN3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eci3Q78JN3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eci3Q78JN3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms