Protein–RNA interactions for Protein: Q76N33

Stambpl1, AMSH-like protease, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stambpl1Q76N33 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Stambpl1Q76N33 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stambpl1Q76N33 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stambpl1Q76N33 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Stambpl1Q76N33 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Stambpl1Q76N33 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Stambpl1Q76N33 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Stambpl1Q76N33 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stambpl1Q76N33 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stambpl1Q76N33 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Stambpl1Q76N33 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Stambpl1Q76N33 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Stambpl1Q76N33 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Stambpl1Q76N33 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Stambpl1Q76N33 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Stambpl1Q76N33 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms