Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPZ3

Zc3h4, Zinc finger CCCH domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h4Q6ZPZ3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Zc3h4Q6ZPZ3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zc3h4Q6ZPZ3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zc3h4Q6ZPZ3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zc3h4Q6ZPZ3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zc3h4Q6ZPZ3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zc3h4Q6ZPZ3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zc3h4Q6ZPZ3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Zc3h4Q6ZPZ3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zc3h4Q6ZPZ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Zc3h4Q6ZPZ3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zc3h4Q6ZPZ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms