Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Smg5Q6ZPY2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Smg5Q6ZPY2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Smg5Q6ZPY2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Smg5Q6ZPY2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg5Q6ZPY2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Smg5Q6ZPY2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg5Q6ZPY2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Smg5Q6ZPY2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smg5Q6ZPY2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg5Q6ZPY2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smg5Q6ZPY2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg5Q6ZPY2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg5Q6ZPY2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Smg5Q6ZPY2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg5Q6ZPY2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg5Q6ZPY2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms