Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS2

Ssxb5, MCG68109, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb5Q6XAS2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssxb5Q6XAS2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ssxb5Q6XAS2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ssxb5Q6XAS2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ssxb5Q6XAS2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ssxb5Q6XAS2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ssxb5Q6XAS2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ssxb5Q6XAS2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ssxb5Q6XAS2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ssxb5Q6XAS2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ssxb5Q6XAS2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ssxb5Q6XAS2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms