Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc88cQ6VGS5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc88cQ6VGS5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc88cQ6VGS5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc88cQ6VGS5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc88cQ6VGS5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc88cQ6VGS5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc88cQ6VGS5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc88cQ6VGS5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc88cQ6VGS5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc88cQ6VGS5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc88cQ6VGS5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc88cQ6VGS5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc88cQ6VGS5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc88cQ6VGS5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms