Protein–RNA interactions for Protein: Q6UGQ3

Scgb2b2, Secretoglobin family 2B member 2, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb2b2Q6UGQ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scgb2b2Q6UGQ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scgb2b2Q6UGQ3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Scgb2b2Q6UGQ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Scgb2b2Q6UGQ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Scgb2b2Q6UGQ3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scgb2b2Q6UGQ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scgb2b2Q6UGQ3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scgb2b2Q6UGQ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scgb2b2Q6UGQ3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Scgb2b2Q6UGQ3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Scgb2b2Q6UGQ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms