Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Krt9Q6RHW0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,07
Krt9Q6RHW0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,9■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Krt9Q6RHW0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27,88■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,87■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,87■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27,86■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27,84■■■□□ 2,05
Krt9Q6RHW0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27,81■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27,8■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27,78■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,04
Krt9Q6RHW0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27,76■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Krt9Q6RHW0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Krt9Q6RHW0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Krt9Q6RHW0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Krt9Q6RHW0 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Krt9Q6RHW0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Krt9Q6RHW0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,68■■■□□ 2,02
Krt9Q6RHW0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Krt9Q6RHW0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,66■■■□□ 2,02
Krt9Q6RHW0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Krt9Q6RHW0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,63■■■□□ 2,01
Krt9Q6RHW0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27,6■■■□□ 2,01
Krt9Q6RHW0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27,59■■■□□ 2,01
Krt9Q6RHW0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Krt9Q6RHW0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27,57■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,57■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,56■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,53■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27,53■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,52■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,52■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,51■■■□□ 2
Krt9Q6RHW0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,51■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,5■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27,46■■□□□ 1,99
Krt9Q6RHW0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,45■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,45■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27,44■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,43■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,42■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27,4■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27,4■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27,39■■□□□ 1,98
Krt9Q6RHW0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27,39■■□□□ 1,97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms