Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHZ2

Camk2d, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2dQ6PHZ2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camk2dQ6PHZ2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camk2dQ6PHZ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camk2dQ6PHZ2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camk2dQ6PHZ2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camk2dQ6PHZ2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camk2dQ6PHZ2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camk2dQ6PHZ2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Camk2dQ6PHZ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Camk2dQ6PHZ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Camk2dQ6PHZ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Camk2dQ6PHZ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Camk2dQ6PHZ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Camk2dQ6PHZ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Camk2dQ6PHZ2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms