Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHU5

Sort1, Sortilin, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sort1Q6PHU5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sort1Q6PHU5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sort1Q6PHU5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sort1Q6PHU5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sort1Q6PHU5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sort1Q6PHU5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sort1Q6PHU5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sort1Q6PHU5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sort1Q6PHU5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sort1Q6PHU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sort1Q6PHU5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sort1Q6PHU5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Sort1Q6PHU5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sort1Q6PHU5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms