Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim45Q6PFY8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim45Q6PFY8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim45Q6PFY8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim45Q6PFY8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Trim45Q6PFY8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trim45Q6PFY8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trim45Q6PFY8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms