Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFC5

Lrit2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit2Q6PFC5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit2Q6PFC5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrit2Q6PFC5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrit2Q6PFC5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit2Q6PFC5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit2Q6PFC5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit2Q6PFC5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrit2Q6PFC5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lrit2Q6PFC5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lrit2Q6PFC5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lrit2Q6PFC5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lrit2Q6PFC5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lrit2Q6PFC5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lrit2Q6PFC5 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrit2Q6PFC5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrit2Q6PFC5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrit2Q6PFC5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lrit2Q6PFC5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lrit2Q6PFC5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms