Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CtifQ6PEE2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CtifQ6PEE2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CtifQ6PEE2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CtifQ6PEE2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CtifQ6PEE2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CtifQ6PEE2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CtifQ6PEE2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CtifQ6PEE2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CtifQ6PEE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CtifQ6PEE2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CtifQ6PEE2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CtifQ6PEE2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
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