Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ1

Cachd1, VWFA and cache domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cachd1Q6PDJ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cachd1Q6PDJ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cachd1Q6PDJ1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cachd1Q6PDJ1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cachd1Q6PDJ1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cachd1Q6PDJ1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cachd1Q6PDJ1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cachd1Q6PDJ1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cachd1Q6PDJ1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cachd1Q6PDJ1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms