Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ9

Prrg3, Transmembrane gamma-carboxyglutamic acid protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrg3Q6PAQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prrg3Q6PAQ9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrg3Q6PAQ9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prrg3Q6PAQ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrg3Q6PAQ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prrg3Q6PAQ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrg3Q6PAQ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prrg3Q6PAQ9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prrg3Q6PAQ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Prrg3Q6PAQ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prrg3Q6PAQ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrg3Q6PAQ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Prrg3Q6PAQ9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prrg3Q6PAQ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrg3Q6PAQ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prrg3Q6PAQ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prrg3Q6PAQ9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prrg3Q6PAQ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prrg3Q6PAQ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prrg3Q6PAQ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prrg3Q6PAQ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prrg3Q6PAQ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms