Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,65■■■■□ 3,3
Nrxn3Q6P9K9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35,63■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35,6■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,59■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,29
Nrxn3Q6P9K9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35,57■■■■□ 3,28
Nrxn3Q6P9K9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35,54■■■■□ 3,28
Nrxn3Q6P9K9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35,53■■■■□ 3,28
Nrxn3Q6P9K9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Nrxn3Q6P9K9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Nrxn3Q6P9K9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Nrxn3Q6P9K9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,27
Nrxn3Q6P9K9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Nrxn3Q6P9K9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Nrxn3Q6P9K9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Nrxn3Q6P9K9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35,47■■■■□ 3,27
Nrxn3Q6P9K9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC35,43■■■■□ 3,26
Nrxn3Q6P9K9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Nrxn3Q6P9K9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Nrxn3Q6P9K9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35,4■■■■□ 3,26
Nrxn3Q6P9K9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35,39■■■■□ 3,26
Nrxn3Q6P9K9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35,35■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35,34■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35,33■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Nrxn3Q6P9K9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,3■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,29■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35,29■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,28■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,27■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Nrxn3Q6P9K9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC35,25■■■■□ 3,23
Nrxn3Q6P9K9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35,24■■■■□ 3,23
Nrxn3Q6P9K9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Nrxn3Q6P9K9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Nrxn3Q6P9K9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Nrxn3Q6P9K9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Nrxn3Q6P9K9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Nrxn3Q6P9K9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,18■■■■□ 3,22
Nrxn3Q6P9K9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35,16■■■■□ 3,22
Nrxn3Q6P9K9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,16■■■■□ 3,22
Nrxn3Q6P9K9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,15■■■■□ 3,22
Nrxn3Q6P9K9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC35,15■■■■□ 3,22
Nrxn3Q6P9K9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Nrxn3Q6P9K9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35,14■■■■□ 3,22
Nrxn3Q6P9K9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC35,13■■■■□ 3,21
Nrxn3Q6P9K9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35,12■■■■□ 3,21
Nrxn3Q6P9K9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Nrxn3Q6P9K9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,11■■■■□ 3,21
Nrxn3Q6P9K9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC35,09■■■■□ 3,21
Nrxn3Q6P9K9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,07■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC35,06■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,06■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35,06■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35,05■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,05■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,04■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35,04■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC35,03■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35,02■■■■□ 3,2
Nrxn3Q6P9K9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3,19
Nrxn3Q6P9K9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,99■■■■□ 3,19
Nrxn3Q6P9K9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC34,98■■■■□ 3,19
Nrxn3Q6P9K9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Nrxn3Q6P9K9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34,98■■■■□ 3,19
Nrxn3Q6P9K9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Nrxn3Q6P9K9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,96■■■■□ 3,19
Nrxn3Q6P9K9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34,95■■■■□ 3,19
Nrxn3Q6P9K9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34,94■■■■□ 3,18
Nrxn3Q6P9K9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,93■■■■□ 3,18
Nrxn3Q6P9K9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Nrxn3Q6P9K9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,92■■■■□ 3,18
Nrxn3Q6P9K9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34,92■■■■□ 3,18
Nrxn3Q6P9K9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34,91■■■■□ 3,18
Nrxn3Q6P9K9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC34,91■■■■□ 3,18
Nrxn3Q6P9K9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34,91■■■■□ 3,18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms