Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L7

Casc4, Protein CASC4, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc4Q6P2L7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Casc4Q6P2L7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Casc4Q6P2L7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Casc4Q6P2L7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Casc4Q6P2L7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Casc4Q6P2L7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Casc4Q6P2L7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Casc4Q6P2L7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Casc4Q6P2L7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms