Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sec23ipQ6NZC7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Sec23ipQ6NZC7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sec23ipQ6NZC7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sec23ipQ6NZC7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sec23ipQ6NZC7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Sec23ipQ6NZC7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Sec23ipQ6NZC7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sec23ipQ6NZC7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms