Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZB0

Dnajc8, DnaJ homolog subfamily C member 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc8Q6NZB0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Dnajc8Q6NZB0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Dnajc8Q6NZB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnajc8Q6NZB0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Dnajc8Q6NZB0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc8Q6NZB0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc8Q6NZB0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc8Q6NZB0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Dnajc8Q6NZB0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Dnajc8Q6NZB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Dnajc8Q6NZB0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Dnajc8Q6NZB0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Dnajc8Q6NZB0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnajc8Q6NZB0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms