Protein–RNA interactions for Protein: Q6J1H4

Utf1, Undifferentiated embryonic cell transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utf1Q6J1H4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Utf1Q6J1H4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Utf1Q6J1H4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utf1Q6J1H4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Utf1Q6J1H4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Utf1Q6J1H4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Utf1Q6J1H4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Utf1Q6J1H4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Utf1Q6J1H4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Utf1Q6J1H4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Utf1Q6J1H4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Utf1Q6J1H4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Utf1Q6J1H4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utf1Q6J1H4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utf1Q6J1H4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Utf1Q6J1H4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Utf1Q6J1H4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Utf1Q6J1H4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Utf1Q6J1H4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms