Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep78Q6IRU7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep78Q6IRU7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep78Q6IRU7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep78Q6IRU7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep78Q6IRU7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep78Q6IRU7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep78Q6IRU7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cep78Q6IRU7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cep78Q6IRU7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cep78Q6IRU7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cep78Q6IRU7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cep78Q6IRU7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cep78Q6IRU7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms