Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Tpm4Q6IRU2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Tpm4Q6IRU2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tpm4Q6IRU2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Tpm4Q6IRU2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Tpm4Q6IRU2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tpm4Q6IRU2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tpm4Q6IRU2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm4Q6IRU2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Tpm4Q6IRU2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Tpm4Q6IRU2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Tpm4Q6IRU2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Tpm4Q6IRU2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Tpm4Q6IRU2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Tpm4Q6IRU2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tpm4Q6IRU2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tpm4Q6IRU2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms