Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZU6

Thsd7a, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, mousemouse

Predictions only

Length 1,645 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd7aQ69ZU6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Thsd7aQ69ZU6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Thsd7aQ69ZU6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Thsd7aQ69ZU6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Thsd7aQ69ZU6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Thsd7aQ69ZU6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Thsd7aQ69ZU6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Thsd7aQ69ZU6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Thsd7aQ69ZU6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Thsd7aQ69ZU6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Thsd7aQ69ZU6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Thsd7aQ69ZU6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Thsd7aQ69ZU6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Thsd7aQ69ZU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Thsd7aQ69ZU6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Thsd7aQ69ZU6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms