Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Sh3rf1Q69ZI1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Sh3rf1Q69ZI1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Sh3rf1Q69ZI1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Sh3rf1Q69ZI1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Sh3rf1Q69ZI1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sh3rf1Q69ZI1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sh3rf1Q69ZI1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms