Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z66

Mysm1, Histone H2A deubiquitinase MYSM1, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mysm1Q69Z66 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mysm1Q69Z66 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Mysm1Q69Z66 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mysm1Q69Z66 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mysm1Q69Z66 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Mysm1Q69Z66 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Mysm1Q69Z66 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Mysm1Q69Z66 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Mysm1Q69Z66 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Mysm1Q69Z66 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Mysm1Q69Z66 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mysm1Q69Z66 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mysm1Q69Z66 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mysm1Q69Z66 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Mysm1Q69Z66 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Mysm1Q69Z66 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Mysm1Q69Z66 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Mysm1Q69Z66 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Mysm1Q69Z66 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Mysm1Q69Z66 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Mysm1Q69Z66 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms