Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Nlrp4fQ66X05 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Nlrp4fQ66X05 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nlrp4fQ66X05 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nlrp4fQ66X05 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nlrp4fQ66X05 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nlrp4fQ66X05 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nlrp4fQ66X05 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Nlrp4fQ66X05 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms