Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fgfr1opQ66JX5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fgfr1opQ66JX5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fgfr1opQ66JX5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgfr1opQ66JX5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fgfr1opQ66JX5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fgfr1opQ66JX5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fgfr1opQ66JX5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fgfr1opQ66JX5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgfr1opQ66JX5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fgfr1opQ66JX5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fgfr1opQ66JX5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Fgfr1opQ66JX5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Fgfr1opQ66JX5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fgfr1opQ66JX5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms