Protein–RNA interactions for Protein: Q64727

Vcl, Vinculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VclQ64727 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VclQ64727 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VclQ64727 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VclQ64727 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VclQ64727 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VclQ64727 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VclQ64727 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VclQ64727 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VclQ64727 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VclQ64727 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VclQ64727 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
VclQ64727 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
VclQ64727 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
VclQ64727 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
VclQ64727 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VclQ64727 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VclQ64727 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VclQ64727 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
VclQ64727 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VclQ64727 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VclQ64727 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VclQ64727 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
VclQ64727 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VclQ64727 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
VclQ64727 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VclQ64727 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VclQ64727 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VclQ64727 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
VclQ64727 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VclQ64727 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
VclQ64727 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
VclQ64727 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
VclQ64727 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
VclQ64727 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VclQ64727 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
VclQ64727 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
VclQ64727 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VclQ64727 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VclQ64727 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VclQ64727 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VclQ64727 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
VclQ64727 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VclQ64727 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VclQ64727 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VclQ64727 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VclQ64727 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VclQ64727 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
VclQ64727 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VclQ64727 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VclQ64727 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VclQ64727 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VclQ64727 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VclQ64727 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VclQ64727 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VclQ64727 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VclQ64727 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VclQ64727 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VclQ64727 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VclQ64727 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VclQ64727 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VclQ64727 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VclQ64727 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
VclQ64727 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VclQ64727 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VclQ64727 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VclQ64727 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VclQ64727 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VclQ64727 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
VclQ64727 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
VclQ64727 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VclQ64727 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VclQ64727 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VclQ64727 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VclQ64727 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
VclQ64727 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
VclQ64727 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
VclQ64727 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
VclQ64727 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
VclQ64727 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
VclQ64727 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VclQ64727 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VclQ64727 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
VclQ64727 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VclQ64727 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VclQ64727 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VclQ64727 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VclQ64727 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VclQ64727 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VclQ64727 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VclQ64727 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VclQ64727 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VclQ64727 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
VclQ64727 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
VclQ64727 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VclQ64727 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
VclQ64727 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VclQ64727 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VclQ64727 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
VclQ64727 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
VclQ64727 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms