Protein–RNA interactions for Protein: Q64697

Ptprcap, Protein tyrosine phosphatase receptor type C-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprcapQ64697 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
PtprcapQ64697 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
PtprcapQ64697 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
PtprcapQ64697 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
PtprcapQ64697 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26,44■■□□□ 1,82
PtprcapQ64697 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,44■■□□□ 1,82
PtprcapQ64697 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26,43■■□□□ 1,82
PtprcapQ64697 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,42■■□□□ 1,82
PtprcapQ64697 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
PtprcapQ64697 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
PtprcapQ64697 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26,38■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26,37■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26,35■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
PtprcapQ64697 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
PtprcapQ64697 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
PtprcapQ64697 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
PtprcapQ64697 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
PtprcapQ64697 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
PtprcapQ64697 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26,28■■□□□ 1,8
PtprcapQ64697 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
PtprcapQ64697 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26,28■■□□□ 1,8
PtprcapQ64697 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,25■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,25■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26,24■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26,23■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26,23■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
PtprcapQ64697 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26,2■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26,16■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26,15■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26,14■■□□□ 1,78
PtprcapQ64697 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26,09■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26,09■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,08■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26,08■■□□□ 1,77
PtprcapQ64697 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,07■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26,07■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26,06■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26,04■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
PtprcapQ64697 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,99■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25,99■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,98■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25,97■■□□□ 1,75
PtprcapQ64697 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,8 ms