Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atp2a3Q64518 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2a3Q64518 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Atp2a3Q64518 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2a3Q64518 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atp2a3Q64518 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2a3Q64518 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Atp2a3Q64518 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp2a3Q64518 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Atp2a3Q64518 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Atp2a3Q64518 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Atp2a3Q64518 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atp2a3Q64518 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atp2a3Q64518 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atp2a3Q64518 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atp2a3Q64518 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atp2a3Q64518 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms